Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB62

Cntrob, Centrobin, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntrobQ8CB62 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CntrobQ8CB62 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CntrobQ8CB62 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CntrobQ8CB62 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CntrobQ8CB62 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CntrobQ8CB62 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CntrobQ8CB62 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CntrobQ8CB62 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CntrobQ8CB62 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CntrobQ8CB62 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CntrobQ8CB62 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CntrobQ8CB62 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CntrobQ8CB62 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CntrobQ8CB62 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CntrobQ8CB62 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CntrobQ8CB62 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CntrobQ8CB62 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms