Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg4aQ8C9S8 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg4aQ8C9S8 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg4aQ8C9S8 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg4aQ8C9S8 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg4aQ8C9S8 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg4aQ8C9S8 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
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Atg4aQ8C9S8 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg4aQ8C9S8 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg4aQ8C9S8 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg4aQ8C9S8 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg4aQ8C9S8 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg4aQ8C9S8 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg4aQ8C9S8 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg4aQ8C9S8 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg4aQ8C9S8 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg4aQ8C9S8 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg4aQ8C9S8 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg4aQ8C9S8 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg4aQ8C9S8 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg4aQ8C9S8 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg4aQ8C9S8 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg4aQ8C9S8 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg4aQ8C9S8 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
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Atg4aQ8C9S8 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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Atg4aQ8C9S8 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
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Atg4aQ8C9S8 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg4aQ8C9S8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg4aQ8C9S8 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg4aQ8C9S8 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg4aQ8C9S8 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg4aQ8C9S8 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg4aQ8C9S8 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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Atg4aQ8C9S8 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg4aQ8C9S8 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Atg4aQ8C9S8 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Atg4aQ8C9S8 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg4aQ8C9S8 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Atg4aQ8C9S8 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Atg4aQ8C9S8 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg4aQ8C9S8 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg4aQ8C9S8 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg4aQ8C9S8 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg4aQ8C9S8 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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Atg4aQ8C9S8 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg4aQ8C9S8 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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Atg4aQ8C9S8 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg4aQ8C9S8 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg4aQ8C9S8 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg4aQ8C9S8 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg4aQ8C9S8 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg4aQ8C9S8 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
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Atg4aQ8C9S8 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg4aQ8C9S8 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg4aQ8C9S8 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg4aQ8C9S8 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg4aQ8C9S8 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg4aQ8C9S8 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg4aQ8C9S8 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg4aQ8C9S8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg4aQ8C9S8 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg4aQ8C9S8 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg4aQ8C9S8 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg4aQ8C9S8 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg4aQ8C9S8 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms