Protein–RNA interactions for Protein: Q8C963

Ccdc159, Coiled-coil domain-containing protein 159, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc159Q8C963 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms