Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U9

Ubqln3, Ubiquilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln3Q8C5U9 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubqln3Q8C5U9 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubqln3Q8C5U9 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubqln3Q8C5U9 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubqln3Q8C5U9 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubqln3Q8C5U9 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubqln3Q8C5U9 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubqln3Q8C5U9 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubqln3Q8C5U9 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubqln3Q8C5U9 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubqln3Q8C5U9 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubqln3Q8C5U9 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubqln3Q8C5U9 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubqln3Q8C5U9 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubqln3Q8C5U9 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubqln3Q8C5U9 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubqln3Q8C5U9 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubqln3Q8C5U9 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubqln3Q8C5U9 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubqln3Q8C5U9 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubqln3Q8C5U9 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubqln3Q8C5U9 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubqln3Q8C5U9 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubqln3Q8C5U9 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubqln3Q8C5U9 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubqln3Q8C5U9 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubqln3Q8C5U9 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubqln3Q8C5U9 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubqln3Q8C5U9 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubqln3Q8C5U9 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubqln3Q8C5U9 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubqln3Q8C5U9 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubqln3Q8C5U9 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubqln3Q8C5U9 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubqln3Q8C5U9 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubqln3Q8C5U9 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubqln3Q8C5U9 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubqln3Q8C5U9 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubqln3Q8C5U9 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubqln3Q8C5U9 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubqln3Q8C5U9 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubqln3Q8C5U9 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubqln3Q8C5U9 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubqln3Q8C5U9 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubqln3Q8C5U9 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubqln3Q8C5U9 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubqln3Q8C5U9 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubqln3Q8C5U9 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubqln3Q8C5U9 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubqln3Q8C5U9 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubqln3Q8C5U9 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubqln3Q8C5U9 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubqln3Q8C5U9 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubqln3Q8C5U9 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubqln3Q8C5U9 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubqln3Q8C5U9 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubqln3Q8C5U9 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubqln3Q8C5U9 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubqln3Q8C5U9 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubqln3Q8C5U9 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubqln3Q8C5U9 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubqln3Q8C5U9 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubqln3Q8C5U9 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubqln3Q8C5U9 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubqln3Q8C5U9 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubqln3Q8C5U9 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubqln3Q8C5U9 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubqln3Q8C5U9 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubqln3Q8C5U9 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubqln3Q8C5U9 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubqln3Q8C5U9 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubqln3Q8C5U9 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubqln3Q8C5U9 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubqln3Q8C5U9 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubqln3Q8C5U9 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubqln3Q8C5U9 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubqln3Q8C5U9 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubqln3Q8C5U9 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubqln3Q8C5U9 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubqln3Q8C5U9 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubqln3Q8C5U9 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubqln3Q8C5U9 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubqln3Q8C5U9 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubqln3Q8C5U9 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubqln3Q8C5U9 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubqln3Q8C5U9 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubqln3Q8C5U9 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubqln3Q8C5U9 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubqln3Q8C5U9 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubqln3Q8C5U9 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubqln3Q8C5U9 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubqln3Q8C5U9 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubqln3Q8C5U9 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubqln3Q8C5U9 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubqln3Q8C5U9 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubqln3Q8C5U9 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubqln3Q8C5U9 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubqln3Q8C5U9 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubqln3Q8C5U9 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubqln3Q8C5U9 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms