Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5C9

TPA-induced transmembrane protein homolog, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C5C9 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q8C5C9 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q8C5C9 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q8C5C9 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q8C5C9 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q8C5C9 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q8C5C9 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q8C5C9 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q8C5C9 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q8C5C9 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q8C5C9 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8C5C9 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8C5C9 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8C5C9 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8C5C9 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8C5C9 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8C5C9 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8C5C9 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8C5C9 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8C5C9 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8C5C9 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8C5C9 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8C5C9 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8C5C9 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8C5C9 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8C5C9 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8C5C9 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8C5C9 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8C5C9 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8C5C9 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8C5C9 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8C5C9 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8C5C9 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8C5C9 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8C5C9 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8C5C9 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8C5C9 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8C5C9 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8C5C9 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8C5C9 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8C5C9 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8C5C9 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8C5C9 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q8C5C9 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q8C5C9 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q8C5C9 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q8C5C9 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q8C5C9 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q8C5C9 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q8C5C9 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Q8C5C9 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q8C5C9 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q8C5C9 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q8C5C9 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q8C5C9 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q8C5C9 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q8C5C9 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q8C5C9 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q8C5C9 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q8C5C9 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q8C5C9 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q8C5C9 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q8C5C9 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q8C5C9 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q8C5C9 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q8C5C9 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q8C5C9 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q8C5C9 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q8C5C9 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q8C5C9 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q8C5C9 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q8C5C9 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Q8C5C9 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q8C5C9 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q8C5C9 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q8C5C9 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q8C5C9 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q8C5C9 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q8C5C9 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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