Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1R3

Uncharacterized protein C17orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C1R3 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8C1R3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q8C1R3 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q8C1R3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q8C1R3 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q8C1R3 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q8C1R3 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8C1R3 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8C1R3 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8C1R3 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8C1R3 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8C1R3 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8C1R3 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8C1R3 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8C1R3 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8C1R3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8C1R3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8C1R3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8C1R3 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8C1R3 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8C1R3 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8C1R3 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8C1R3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8C1R3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8C1R3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8C1R3 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8C1R3 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8C1R3 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8C1R3 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8C1R3 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8C1R3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8C1R3 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8C1R3 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8C1R3 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8C1R3 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8C1R3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8C1R3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8C1R3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8C1R3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8C1R3 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8C1R3 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8C1R3 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8C1R3 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8C1R3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8C1R3 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8C1R3 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8C1R3 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8C1R3 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8C1R3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8C1R3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8C1R3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8C1R3 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8C1R3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8C1R3 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8C1R3 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8C1R3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8C1R3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8C1R3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8C1R3 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8C1R3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8C1R3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8C1R3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8C1R3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8C1R3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8C1R3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8C1R3 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8C1R3 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8C1R3 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8C1R3 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms