Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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