Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp5Q8BX09 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms