Protein–RNA interactions for Protein: Q8BR65

Suds3, Sin3 histone deacetylase corepressor complex component SDS3, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Suds3Q8BR65 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Suds3Q8BR65 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Suds3Q8BR65 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Suds3Q8BR65 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms