Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKN5

Tubgcp5, Gamma-tubulin complex component 5, mousemouse

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Length 1,024 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp5Q8BKN5 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Tubgcp5Q8BKN5 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubgcp5Q8BKN5 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubgcp5Q8BKN5 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubgcp5Q8BKN5 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubgcp5Q8BKN5 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubgcp5Q8BKN5 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubgcp5Q8BKN5 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubgcp5Q8BKN5 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubgcp5Q8BKN5 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubgcp5Q8BKN5 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubgcp5Q8BKN5 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubgcp5Q8BKN5 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubgcp5Q8BKN5 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubgcp5Q8BKN5 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubgcp5Q8BKN5 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubgcp5Q8BKN5 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubgcp5Q8BKN5 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubgcp5Q8BKN5 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Tubgcp5Q8BKN5 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubgcp5Q8BKN5 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubgcp5Q8BKN5 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubgcp5Q8BKN5 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubgcp5Q8BKN5 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubgcp5Q8BKN5 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Tubgcp5Q8BKN5 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubgcp5Q8BKN5 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Tubgcp5Q8BKN5 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Tubgcp5Q8BKN5 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubgcp5Q8BKN5 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Tubgcp5Q8BKN5 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Tubgcp5Q8BKN5 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubgcp5Q8BKN5 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubgcp5Q8BKN5 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubgcp5Q8BKN5 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubgcp5Q8BKN5 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubgcp5Q8BKN5 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubgcp5Q8BKN5 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubgcp5Q8BKN5 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubgcp5Q8BKN5 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubgcp5Q8BKN5 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubgcp5Q8BKN5 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubgcp5Q8BKN5 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubgcp5Q8BKN5 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubgcp5Q8BKN5 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubgcp5Q8BKN5 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubgcp5Q8BKN5 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubgcp5Q8BKN5 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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