Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJ71

Nup93, Nuclear pore complex protein Nup93, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup93Q8BJ71 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup93Q8BJ71 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup93Q8BJ71 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup93Q8BJ71 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup93Q8BJ71 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nup93Q8BJ71 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nup93Q8BJ71 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nup93Q8BJ71 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms