Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHJ7

Gabra5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra5Q8BHJ7 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabra5Q8BHJ7 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabra5Q8BHJ7 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabra5Q8BHJ7 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabra5Q8BHJ7 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabra5Q8BHJ7 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabra5Q8BHJ7 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabra5Q8BHJ7 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabra5Q8BHJ7 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabra5Q8BHJ7 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabra5Q8BHJ7 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabra5Q8BHJ7 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabra5Q8BHJ7 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabra5Q8BHJ7 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabra5Q8BHJ7 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabra5Q8BHJ7 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabra5Q8BHJ7 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabra5Q8BHJ7 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabra5Q8BHJ7 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabra5Q8BHJ7 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabra5Q8BHJ7 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabra5Q8BHJ7 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabra5Q8BHJ7 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabra5Q8BHJ7 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabra5Q8BHJ7 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabra5Q8BHJ7 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabra5Q8BHJ7 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabra5Q8BHJ7 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra5Q8BHJ7 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms