Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG71

Trmt12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt12Q8BG71 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trmt12Q8BG71 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trmt12Q8BG71 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trmt12Q8BG71 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trmt12Q8BG71 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trmt12Q8BG71 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trmt12Q8BG71 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trmt12Q8BG71 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trmt12Q8BG71 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trmt12Q8BG71 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trmt12Q8BG71 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trmt12Q8BG71 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trmt12Q8BG71 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trmt12Q8BG71 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trmt12Q8BG71 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trmt12Q8BG71 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trmt12Q8BG71 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trmt12Q8BG71 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trmt12Q8BG71 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trmt12Q8BG71 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trmt12Q8BG71 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trmt12Q8BG71 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trmt12Q8BG71 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trmt12Q8BG71 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trmt12Q8BG71 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trmt12Q8BG71 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trmt12Q8BG71 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trmt12Q8BG71 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trmt12Q8BG71 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trmt12Q8BG71 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trmt12Q8BG71 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trmt12Q8BG71 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trmt12Q8BG71 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trmt12Q8BG71 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trmt12Q8BG71 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trmt12Q8BG71 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trmt12Q8BG71 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trmt12Q8BG71 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trmt12Q8BG71 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trmt12Q8BG71 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trmt12Q8BG71 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trmt12Q8BG71 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trmt12Q8BG71 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trmt12Q8BG71 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trmt12Q8BG71 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trmt12Q8BG71 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trmt12Q8BG71 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trmt12Q8BG71 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trmt12Q8BG71 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trmt12Q8BG71 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trmt12Q8BG71 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trmt12Q8BG71 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trmt12Q8BG71 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trmt12Q8BG71 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trmt12Q8BG71 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trmt12Q8BG71 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trmt12Q8BG71 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trmt12Q8BG71 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trmt12Q8BG71 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trmt12Q8BG71 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trmt12Q8BG71 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trmt12Q8BG71 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trmt12Q8BG71 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trmt12Q8BG71 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trmt12Q8BG71 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trmt12Q8BG71 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trmt12Q8BG71 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trmt12Q8BG71 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trmt12Q8BG71 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trmt12Q8BG71 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trmt12Q8BG71 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trmt12Q8BG71 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trmt12Q8BG71 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trmt12Q8BG71 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trmt12Q8BG71 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trmt12Q8BG71 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trmt12Q8BG71 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trmt12Q8BG71 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trmt12Q8BG71 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trmt12Q8BG71 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trmt12Q8BG71 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trmt12Q8BG71 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trmt12Q8BG71 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trmt12Q8BG71 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trmt12Q8BG71 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trmt12Q8BG71 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trmt12Q8BG71 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trmt12Q8BG71 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trmt12Q8BG71 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trmt12Q8BG71 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trmt12Q8BG71 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trmt12Q8BG71 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trmt12Q8BG71 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trmt12Q8BG71 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trmt12Q8BG71 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trmt12Q8BG71 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trmt12Q8BG71 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trmt12Q8BG71 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trmt12Q8BG71 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trmt12Q8BG71 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.6 ms