Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms