Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms