Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo1Q80ZD8 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Amigo1Q80ZD8 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Amigo1Q80ZD8 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Amigo1Q80ZD8 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Amigo1Q80ZD8 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Amigo1Q80ZD8 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Amigo1Q80ZD8 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Amigo1Q80ZD8 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Amigo1Q80ZD8 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Amigo1Q80ZD8 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Amigo1Q80ZD8 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Amigo1Q80ZD8 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Amigo1Q80ZD8 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Amigo1Q80ZD8 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amigo1Q80ZD8 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amigo1Q80ZD8 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amigo1Q80ZD8 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amigo1Q80ZD8 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amigo1Q80ZD8 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amigo1Q80ZD8 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amigo1Q80ZD8 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amigo1Q80ZD8 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amigo1Q80ZD8 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amigo1Q80ZD8 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amigo1Q80ZD8 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amigo1Q80ZD8 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amigo1Q80ZD8 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amigo1Q80ZD8 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amigo1Q80ZD8 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Amigo1Q80ZD8 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amigo1Q80ZD8 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amigo1Q80ZD8 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amigo1Q80ZD8 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amigo1Q80ZD8 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amigo1Q80ZD8 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amigo1Q80ZD8 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amigo1Q80ZD8 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amigo1Q80ZD8 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amigo1Q80ZD8 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amigo1Q80ZD8 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amigo1Q80ZD8 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Amigo1Q80ZD8 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Amigo1Q80ZD8 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Amigo1Q80ZD8 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Amigo1Q80ZD8 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Amigo1Q80ZD8 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Amigo1Q80ZD8 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Amigo1Q80ZD8 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Amigo1Q80ZD8 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Amigo1Q80ZD8 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Amigo1Q80ZD8 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Amigo1Q80ZD8 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Amigo1Q80ZD8 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Amigo1Q80ZD8 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Amigo1Q80ZD8 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Amigo1Q80ZD8 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Amigo1Q80ZD8 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Amigo1Q80ZD8 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Amigo1Q80ZD8 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Amigo1Q80ZD8 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Amigo1Q80ZD8 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Amigo1Q80ZD8 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Amigo1Q80ZD8 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Amigo1Q80ZD8 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Amigo1Q80ZD8 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Amigo1Q80ZD8 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Amigo1Q80ZD8 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Amigo1Q80ZD8 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Amigo1Q80ZD8 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
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Amigo1Q80ZD8 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Amigo1Q80ZD8 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Amigo1Q80ZD8 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Amigo1Q80ZD8 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Amigo1Q80ZD8 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Amigo1Q80ZD8 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Amigo1Q80ZD8 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Amigo1Q80ZD8 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Amigo1Q80ZD8 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Amigo1Q80ZD8 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Amigo1Q80ZD8 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Amigo1Q80ZD8 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Amigo1Q80ZD8 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Amigo1Q80ZD8 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Amigo1Q80ZD8 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Amigo1Q80ZD8 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Amigo1Q80ZD8 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Amigo1Q80ZD8 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Amigo1Q80ZD8 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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