Protein–RNA interactions for Protein: Q80YS9

Stkld1, Serine/threonine kinase-like domain-containing protein STKLD1, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stkld1Q80YS9 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stkld1Q80YS9 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stkld1Q80YS9 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stkld1Q80YS9 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Stkld1Q80YS9 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stkld1Q80YS9 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stkld1Q80YS9 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Stkld1Q80YS9 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stkld1Q80YS9 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stkld1Q80YS9 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stkld1Q80YS9 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stkld1Q80YS9 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stkld1Q80YS9 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stkld1Q80YS9 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stkld1Q80YS9 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stkld1Q80YS9 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stkld1Q80YS9 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stkld1Q80YS9 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stkld1Q80YS9 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stkld1Q80YS9 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stkld1Q80YS9 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stkld1Q80YS9 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stkld1Q80YS9 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stkld1Q80YS9 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stkld1Q80YS9 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stkld1Q80YS9 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stkld1Q80YS9 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Stkld1Q80YS9 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stkld1Q80YS9 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stkld1Q80YS9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stkld1Q80YS9 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stkld1Q80YS9 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stkld1Q80YS9 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stkld1Q80YS9 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stkld1Q80YS9 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stkld1Q80YS9 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stkld1Q80YS9 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stkld1Q80YS9 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stkld1Q80YS9 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stkld1Q80YS9 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stkld1Q80YS9 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stkld1Q80YS9 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stkld1Q80YS9 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stkld1Q80YS9 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stkld1Q80YS9 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stkld1Q80YS9 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stkld1Q80YS9 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stkld1Q80YS9 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stkld1Q80YS9 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stkld1Q80YS9 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Stkld1Q80YS9 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stkld1Q80YS9 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stkld1Q80YS9 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stkld1Q80YS9 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stkld1Q80YS9 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stkld1Q80YS9 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stkld1Q80YS9 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stkld1Q80YS9 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stkld1Q80YS9 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stkld1Q80YS9 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stkld1Q80YS9 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Stkld1Q80YS9 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stkld1Q80YS9 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Stkld1Q80YS9 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stkld1Q80YS9 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Stkld1Q80YS9 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stkld1Q80YS9 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stkld1Q80YS9 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stkld1Q80YS9 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stkld1Q80YS9 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stkld1Q80YS9 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stkld1Q80YS9 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stkld1Q80YS9 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms