Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Ttc28Q80XJ3 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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