Protein–RNA interactions for Protein: Q80U04

Pja2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja2Q80U04 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms