Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT28

Rexo1, RNA exonuclease 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo1Q7TT28 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms