Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH4

Ccp110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccp110Q7TSH4 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ccp110Q7TSH4 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
Ccp110Q7TSH4 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccp110Q7TSH4 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccp110Q7TSH4 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccp110Q7TSH4 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccp110Q7TSH4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccp110Q7TSH4 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccp110Q7TSH4 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccp110Q7TSH4 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccp110Q7TSH4 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccp110Q7TSH4 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccp110Q7TSH4 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccp110Q7TSH4 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccp110Q7TSH4 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccp110Q7TSH4 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccp110Q7TSH4 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccp110Q7TSH4 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccp110Q7TSH4 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccp110Q7TSH4 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccp110Q7TSH4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccp110Q7TSH4 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccp110Q7TSH4 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccp110Q7TSH4 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccp110Q7TSH4 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccp110Q7TSH4 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccp110Q7TSH4 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccp110Q7TSH4 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccp110Q7TSH4 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccp110Q7TSH4 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccp110Q7TSH4 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccp110Q7TSH4 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccp110Q7TSH4 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccp110Q7TSH4 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccp110Q7TSH4 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccp110Q7TSH4 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccp110Q7TSH4 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccp110Q7TSH4 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccp110Q7TSH4 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccp110Q7TSH4 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccp110Q7TSH4 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccp110Q7TSH4 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccp110Q7TSH4 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccp110Q7TSH4 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccp110Q7TSH4 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccp110Q7TSH4 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccp110Q7TSH4 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccp110Q7TSH4 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccp110Q7TSH4 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccp110Q7TSH4 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccp110Q7TSH4 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccp110Q7TSH4 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccp110Q7TSH4 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccp110Q7TSH4 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms