Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH3

Znf516, Zinc finger protein 516, mousemouse

Predictions only

Length 1,157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf516Q7TSH3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Znf516Q7TSH3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Znf516Q7TSH3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Znf516Q7TSH3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Znf516Q7TSH3 Cd3e-201ENSMUST00000102832 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Znf516Q7TSH3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Znf516Q7TSH3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Znf516Q7TSH3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Znf516Q7TSH3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf516Q7TSH3 Gm42852-201ENSMUST00000202649 1379 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf516Q7TSH3 Olfr282-203ENSMUST00000213608 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf516Q7TSH3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf516Q7TSH3 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf516Q7TSH3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf516Q7TSH3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf516Q7TSH3 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf516Q7TSH3 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf516Q7TSH3 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf516Q7TSH3 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf516Q7TSH3 Gm8988-201ENSMUST00000155015 1240 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf516Q7TSH3 D6Ertd474e-203ENSMUST00000160188 683 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf516Q7TSH3 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf516Q7TSH3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf516Q7TSH3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf516Q7TSH3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf516Q7TSH3 Gm37612-201ENSMUST00000193626 582 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf516Q7TSH3 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf516Q7TSH3 1700047N06Rik-201ENSMUST00000194474 920 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf516Q7TSH3 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf516Q7TSH3 Sult3a1-202ENSMUST00000218204 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf516Q7TSH3 AC152414.2-201ENSMUST00000219620 537 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf516Q7TSH3 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf516Q7TSH3 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf516Q7TSH3 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf516Q7TSH3 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf516Q7TSH3 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf516Q7TSH3 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf516Q7TSH3 Sult3a1-201ENSMUST00000092597 1047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf516Q7TSH3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf516Q7TSH3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf516Q7TSH3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf516Q7TSH3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf516Q7TSH3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf516Q7TSH3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf516Q7TSH3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf516Q7TSH3 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf516Q7TSH3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf516Q7TSH3 4930589L23Rik-201ENSMUST00000091023 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf516Q7TSH3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf516Q7TSH3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf516Q7TSH3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf516Q7TSH3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf516Q7TSH3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf516Q7TSH3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf516Q7TSH3 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf516Q7TSH3 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf516Q7TSH3 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf516Q7TSH3 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf516Q7TSH3 Scgb2a2-201ENSMUST00000179814 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf516Q7TSH3 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf516Q7TSH3 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf516Q7TSH3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf516Q7TSH3 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf516Q7TSH3 Acbd7-202ENSMUST00000228935 534 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf516Q7TSH3 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf516Q7TSH3 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf516Q7TSH3 Olfr1260-201ENSMUST00000061830 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf516Q7TSH3 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf516Q7TSH3 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf516Q7TSH3 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf516Q7TSH3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf516Q7TSH3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf516Q7TSH3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf516Q7TSH3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf516Q7TSH3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf516Q7TSH3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf516Q7TSH3 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf516Q7TSH3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf516Q7TSH3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf516Q7TSH3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf516Q7TSH3 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf516Q7TSH3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf516Q7TSH3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf516Q7TSH3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf516Q7TSH3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf516Q7TSH3 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf516Q7TSH3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf516Q7TSH3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf516Q7TSH3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf516Q7TSH3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf516Q7TSH3 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf516Q7TSH3 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf516Q7TSH3 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf516Q7TSH3 Gm15061-201ENSMUST00000121076 1046 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf516Q7TSH3 Gm15597-201ENSMUST00000145924 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf516Q7TSH3 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf516Q7TSH3 Gm28941-201ENSMUST00000185536 1017 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf516Q7TSH3 4930595O18Rik-201ENSMUST00000205099 607 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf516Q7TSH3 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf516Q7TSH3 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms