Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH2

Phkb, Phosphorylase b kinase regulatory subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PhkbQ7TSH2 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PhkbQ7TSH2 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PhkbQ7TSH2 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PhkbQ7TSH2 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PhkbQ7TSH2 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PhkbQ7TSH2 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PhkbQ7TSH2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PhkbQ7TSH2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PhkbQ7TSH2 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PhkbQ7TSH2 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PhkbQ7TSH2 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PhkbQ7TSH2 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PhkbQ7TSH2 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PhkbQ7TSH2 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PhkbQ7TSH2 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PhkbQ7TSH2 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PhkbQ7TSH2 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PhkbQ7TSH2 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PhkbQ7TSH2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PhkbQ7TSH2 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PhkbQ7TSH2 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PhkbQ7TSH2 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PhkbQ7TSH2 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PhkbQ7TSH2 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PhkbQ7TSH2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PhkbQ7TSH2 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PhkbQ7TSH2 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PhkbQ7TSH2 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PhkbQ7TSH2 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PhkbQ7TSH2 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PhkbQ7TSH2 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PhkbQ7TSH2 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PhkbQ7TSH2 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PhkbQ7TSH2 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PhkbQ7TSH2 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PhkbQ7TSH2 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PhkbQ7TSH2 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PhkbQ7TSH2 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PhkbQ7TSH2 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PhkbQ7TSH2 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PhkbQ7TSH2 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PhkbQ7TSH2 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PhkbQ7TSH2 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PhkbQ7TSH2 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PhkbQ7TSH2 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PhkbQ7TSH2 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PhkbQ7TSH2 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PhkbQ7TSH2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PhkbQ7TSH2 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PhkbQ7TSH2 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PhkbQ7TSH2 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PhkbQ7TSH2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PhkbQ7TSH2 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PhkbQ7TSH2 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PhkbQ7TSH2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PhkbQ7TSH2 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PhkbQ7TSH2 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PhkbQ7TSH2 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PhkbQ7TSH2 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PhkbQ7TSH2 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PhkbQ7TSH2 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PhkbQ7TSH2 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PhkbQ7TSH2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PhkbQ7TSH2 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PhkbQ7TSH2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PhkbQ7TSH2 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PhkbQ7TSH2 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PhkbQ7TSH2 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PhkbQ7TSH2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PhkbQ7TSH2 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PhkbQ7TSH2 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PhkbQ7TSH2 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PhkbQ7TSH2 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PhkbQ7TSH2 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PhkbQ7TSH2 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PhkbQ7TSH2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PhkbQ7TSH2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PhkbQ7TSH2 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PhkbQ7TSH2 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PhkbQ7TSH2 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PhkbQ7TSH2 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PhkbQ7TSH2 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PhkbQ7TSH2 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PhkbQ7TSH2 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PhkbQ7TSH2 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PhkbQ7TSH2 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PhkbQ7TSH2 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PhkbQ7TSH2 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PhkbQ7TSH2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PhkbQ7TSH2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PhkbQ7TSH2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PhkbQ7TSH2 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PhkbQ7TSH2 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PhkbQ7TSH2 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PhkbQ7TSH2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PhkbQ7TSH2 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PhkbQ7TSH2 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PhkbQ7TSH2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PhkbQ7TSH2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PhkbQ7TSH2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms