Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
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Dsg1bQ7TSF1 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms