Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms