Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms