Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS58

Clec4b1, Antigen presenting cell lectin-like receptor A2, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4b1Q7TS58 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clec4b1Q7TS58 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clec4b1Q7TS58 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clec4b1Q7TS58 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clec4b1Q7TS58 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clec4b1Q7TS58 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clec4b1Q7TS58 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clec4b1Q7TS58 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clec4b1Q7TS58 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clec4b1Q7TS58 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Clec4b1Q7TS58 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clec4b1Q7TS58 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clec4b1Q7TS58 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clec4b1Q7TS58 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clec4b1Q7TS58 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clec4b1Q7TS58 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clec4b1Q7TS58 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clec4b1Q7TS58 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clec4b1Q7TS58 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clec4b1Q7TS58 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clec4b1Q7TS58 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clec4b1Q7TS58 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clec4b1Q7TS58 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clec4b1Q7TS58 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clec4b1Q7TS58 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clec4b1Q7TS58 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clec4b1Q7TS58 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms