Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms