Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN16

Hhip, Hedgehog-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HhipQ7TN16 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms