Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Shq1Q7TMX5 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Shq1Q7TMX5 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Shq1Q7TMX5 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Shq1Q7TMX5 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Shq1Q7TMX5 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Shq1Q7TMX5 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Shq1Q7TMX5 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Shq1Q7TMX5 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Shq1Q7TMX5 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Shq1Q7TMX5 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Shq1Q7TMX5 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Shq1Q7TMX5 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Shq1Q7TMX5 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Shq1Q7TMX5 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Shq1Q7TMX5 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Shq1Q7TMX5 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Shq1Q7TMX5 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Shq1Q7TMX5 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Shq1Q7TMX5 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Shq1Q7TMX5 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Shq1Q7TMX5 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Shq1Q7TMX5 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Shq1Q7TMX5 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Shq1Q7TMX5 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Shq1Q7TMX5 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Shq1Q7TMX5 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Shq1Q7TMX5 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Shq1Q7TMX5 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Shq1Q7TMX5 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Shq1Q7TMX5 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Shq1Q7TMX5 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Shq1Q7TMX5 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Shq1Q7TMX5 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Shq1Q7TMX5 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Shq1Q7TMX5 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Shq1Q7TMX5 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Shq1Q7TMX5 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Shq1Q7TMX5 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Shq1Q7TMX5 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Shq1Q7TMX5 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Shq1Q7TMX5 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Shq1Q7TMX5 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Shq1Q7TMX5 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Shq1Q7TMX5 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Shq1Q7TMX5 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Shq1Q7TMX5 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Shq1Q7TMX5 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Shq1Q7TMX5 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Shq1Q7TMX5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Shq1Q7TMX5 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Shq1Q7TMX5 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Shq1Q7TMX5 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Shq1Q7TMX5 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Shq1Q7TMX5 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Shq1Q7TMX5 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Shq1Q7TMX5 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Shq1Q7TMX5 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Shq1Q7TMX5 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Shq1Q7TMX5 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Shq1Q7TMX5 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Shq1Q7TMX5 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Shq1Q7TMX5 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Shq1Q7TMX5 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Shq1Q7TMX5 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Shq1Q7TMX5 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Shq1Q7TMX5 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Shq1Q7TMX5 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Shq1Q7TMX5 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Shq1Q7TMX5 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Shq1Q7TMX5 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Shq1Q7TMX5 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Shq1Q7TMX5 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Shq1Q7TMX5 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Shq1Q7TMX5 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Shq1Q7TMX5 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms