Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
ScocQ78YZ6 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
ScocQ78YZ6 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.14
ScocQ78YZ6 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
ScocQ78YZ6 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
ScocQ78YZ6 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
ScocQ78YZ6 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ScocQ78YZ6 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ScocQ78YZ6 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ScocQ78YZ6 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ScocQ78YZ6 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ScocQ78YZ6 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ScocQ78YZ6 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ScocQ78YZ6 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ScocQ78YZ6 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ScocQ78YZ6 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ScocQ78YZ6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ScocQ78YZ6 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ScocQ78YZ6 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ScocQ78YZ6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
ScocQ78YZ6 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ScocQ78YZ6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ScocQ78YZ6 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ScocQ78YZ6 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ScocQ78YZ6 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ScocQ78YZ6 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ScocQ78YZ6 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
ScocQ78YZ6 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ScocQ78YZ6 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ScocQ78YZ6 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ScocQ78YZ6 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ScocQ78YZ6 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ScocQ78YZ6 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ScocQ78YZ6 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ScocQ78YZ6 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ScocQ78YZ6 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ScocQ78YZ6 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ScocQ78YZ6 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ScocQ78YZ6 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ScocQ78YZ6 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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