Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms