Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWZ2

Ube2r2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2r2Q6ZWZ2 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms