Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS8

Spop, Speckle-type POZ protein, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpopQ6ZWS8 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SpopQ6ZWS8 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SpopQ6ZWS8 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SpopQ6ZWS8 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SpopQ6ZWS8 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SpopQ6ZWS8 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SpopQ6ZWS8 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SpopQ6ZWS8 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SpopQ6ZWS8 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SpopQ6ZWS8 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms