Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Topbp1Q6ZQF0 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Topbp1Q6ZQF0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Topbp1Q6ZQF0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Topbp1Q6ZQF0 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Topbp1Q6ZQF0 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Topbp1Q6ZQF0 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Topbp1Q6ZQF0 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Topbp1Q6ZQF0 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Topbp1Q6ZQF0 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Topbp1Q6ZQF0 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Topbp1Q6ZQF0 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Topbp1Q6ZQF0 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Topbp1Q6ZQF0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Topbp1Q6ZQF0 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Topbp1Q6ZQF0 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Topbp1Q6ZQF0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Topbp1Q6ZQF0 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Topbp1Q6ZQF0 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Topbp1Q6ZQF0 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Topbp1Q6ZQF0 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Topbp1Q6ZQF0 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Topbp1Q6ZQF0 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Topbp1Q6ZQF0 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Topbp1Q6ZQF0 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Topbp1Q6ZQF0 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Topbp1Q6ZQF0 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Topbp1Q6ZQF0 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Topbp1Q6ZQF0 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Topbp1Q6ZQF0 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Topbp1Q6ZQF0 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Topbp1Q6ZQF0 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Topbp1Q6ZQF0 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Topbp1Q6ZQF0 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Topbp1Q6ZQF0 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Topbp1Q6ZQF0 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Topbp1Q6ZQF0 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Topbp1Q6ZQF0 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Topbp1Q6ZQF0 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Topbp1Q6ZQF0 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Topbp1Q6ZQF0 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Topbp1Q6ZQF0 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Topbp1Q6ZQF0 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Topbp1Q6ZQF0 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Topbp1Q6ZQF0 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Topbp1Q6ZQF0 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Topbp1Q6ZQF0 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Topbp1Q6ZQF0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Topbp1Q6ZQF0 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Topbp1Q6ZQF0 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Topbp1Q6ZQF0 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms