Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ12

Ninl, Ninein-like protein, mousemouse

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Length 1,394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinlQ6ZQ12 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NinlQ6ZQ12 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NinlQ6ZQ12 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NinlQ6ZQ12 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NinlQ6ZQ12 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NinlQ6ZQ12 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NinlQ6ZQ12 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NinlQ6ZQ12 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
NinlQ6ZQ12 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NinlQ6ZQ12 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NinlQ6ZQ12 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NinlQ6ZQ12 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NinlQ6ZQ12 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
NinlQ6ZQ12 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NinlQ6ZQ12 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NinlQ6ZQ12 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NinlQ6ZQ12 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NinlQ6ZQ12 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NinlQ6ZQ12 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NinlQ6ZQ12 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NinlQ6ZQ12 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NinlQ6ZQ12 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NinlQ6ZQ12 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NinlQ6ZQ12 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NinlQ6ZQ12 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NinlQ6ZQ12 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NinlQ6ZQ12 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NinlQ6ZQ12 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NinlQ6ZQ12 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NinlQ6ZQ12 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NinlQ6ZQ12 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NinlQ6ZQ12 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NinlQ6ZQ12 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NinlQ6ZQ12 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NinlQ6ZQ12 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NinlQ6ZQ12 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NinlQ6ZQ12 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NinlQ6ZQ12 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NinlQ6ZQ12 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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NinlQ6ZQ12 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
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NinlQ6ZQ12 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NinlQ6ZQ12 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NinlQ6ZQ12 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NinlQ6ZQ12 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
NinlQ6ZQ12 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NinlQ6ZQ12 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NinlQ6ZQ12 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NinlQ6ZQ12 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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NinlQ6ZQ12 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NinlQ6ZQ12 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NinlQ6ZQ12 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NinlQ6ZQ12 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NinlQ6ZQ12 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NinlQ6ZQ12 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NinlQ6ZQ12 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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NinlQ6ZQ12 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NinlQ6ZQ12 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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NinlQ6ZQ12 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NinlQ6ZQ12 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NinlQ6ZQ12 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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NinlQ6ZQ12 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NinlQ6ZQ12 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NinlQ6ZQ12 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
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NinlQ6ZQ12 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NinlQ6ZQ12 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NinlQ6ZQ12 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NinlQ6ZQ12 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NinlQ6ZQ12 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NinlQ6ZQ12 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NinlQ6ZQ12 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NinlQ6ZQ12 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NinlQ6ZQ12 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NinlQ6ZQ12 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NinlQ6ZQ12 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NinlQ6ZQ12 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NinlQ6ZQ12 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NinlQ6ZQ12 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NinlQ6ZQ12 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NinlQ6ZQ12 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NinlQ6ZQ12 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NinlQ6ZQ12 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NinlQ6ZQ12 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms