Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms