Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHP6

Lrrn2, Leucine rich repeat protein 2, neuronal, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn2Q6PHP6 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrrn2Q6PHP6 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrrn2Q6PHP6 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrrn2Q6PHP6 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrrn2Q6PHP6 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrrn2Q6PHP6 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrrn2Q6PHP6 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrrn2Q6PHP6 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrrn2Q6PHP6 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrrn2Q6PHP6 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrrn2Q6PHP6 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrrn2Q6PHP6 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrrn2Q6PHP6 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrrn2Q6PHP6 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrrn2Q6PHP6 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrrn2Q6PHP6 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrrn2Q6PHP6 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrrn2Q6PHP6 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrrn2Q6PHP6 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrrn2Q6PHP6 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrrn2Q6PHP6 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrn2Q6PHP6 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrn2Q6PHP6 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrn2Q6PHP6 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrn2Q6PHP6 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrn2Q6PHP6 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrn2Q6PHP6 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrn2Q6PHP6 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrn2Q6PHP6 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrn2Q6PHP6 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrn2Q6PHP6 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrn2Q6PHP6 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrn2Q6PHP6 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrn2Q6PHP6 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrn2Q6PHP6 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrn2Q6PHP6 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrn2Q6PHP6 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrn2Q6PHP6 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrn2Q6PHP6 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrn2Q6PHP6 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrn2Q6PHP6 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrn2Q6PHP6 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrn2Q6PHP6 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrn2Q6PHP6 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrrn2Q6PHP6 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrrn2Q6PHP6 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrrn2Q6PHP6 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrrn2Q6PHP6 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrrn2Q6PHP6 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrrn2Q6PHP6 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrrn2Q6PHP6 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrrn2Q6PHP6 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrrn2Q6PHP6 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrrn2Q6PHP6 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrrn2Q6PHP6 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrrn2Q6PHP6 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrrn2Q6PHP6 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrrn2Q6PHP6 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrrn2Q6PHP6 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrrn2Q6PHP6 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrrn2Q6PHP6 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrrn2Q6PHP6 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrrn2Q6PHP6 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrrn2Q6PHP6 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrrn2Q6PHP6 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrrn2Q6PHP6 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrrn2Q6PHP6 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrrn2Q6PHP6 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrrn2Q6PHP6 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrrn2Q6PHP6 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrrn2Q6PHP6 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrrn2Q6PHP6 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrrn2Q6PHP6 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrrn2Q6PHP6 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrrn2Q6PHP6 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrrn2Q6PHP6 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrrn2Q6PHP6 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrrn2Q6PHP6 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrrn2Q6PHP6 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrrn2Q6PHP6 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrrn2Q6PHP6 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrrn2Q6PHP6 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrrn2Q6PHP6 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrrn2Q6PHP6 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrrn2Q6PHP6 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lrrn2Q6PHP6 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lrrn2Q6PHP6 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lrrn2Q6PHP6 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrrn2Q6PHP6 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrrn2Q6PHP6 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrrn2Q6PHP6 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrrn2Q6PHP6 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrrn2Q6PHP6 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrrn2Q6PHP6 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrrn2Q6PHP6 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrrn2Q6PHP6 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrrn2Q6PHP6 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrrn2Q6PHP6 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrrn2Q6PHP6 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrrn2Q6PHP6 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms