Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF3

Med16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med16Q6PGF3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Med16Q6PGF3 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Med16Q6PGF3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Med16Q6PGF3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Med16Q6PGF3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Med16Q6PGF3 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Med16Q6PGF3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Med16Q6PGF3 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Med16Q6PGF3 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Med16Q6PGF3 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Med16Q6PGF3 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Med16Q6PGF3 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Med16Q6PGF3 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Med16Q6PGF3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Med16Q6PGF3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Med16Q6PGF3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Med16Q6PGF3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Med16Q6PGF3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Med16Q6PGF3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Med16Q6PGF3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Med16Q6PGF3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Med16Q6PGF3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Med16Q6PGF3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Med16Q6PGF3 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Med16Q6PGF3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Med16Q6PGF3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Med16Q6PGF3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Med16Q6PGF3 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Med16Q6PGF3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Med16Q6PGF3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Med16Q6PGF3 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Med16Q6PGF3 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Med16Q6PGF3 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Med16Q6PGF3 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Med16Q6PGF3 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Med16Q6PGF3 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Med16Q6PGF3 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Med16Q6PGF3 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Med16Q6PGF3 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Med16Q6PGF3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Med16Q6PGF3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Med16Q6PGF3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Med16Q6PGF3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Med16Q6PGF3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Med16Q6PGF3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Med16Q6PGF3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Med16Q6PGF3 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Med16Q6PGF3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Med16Q6PGF3 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Med16Q6PGF3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Med16Q6PGF3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Med16Q6PGF3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Med16Q6PGF3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Med16Q6PGF3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Med16Q6PGF3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Med16Q6PGF3 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Med16Q6PGF3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Med16Q6PGF3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Med16Q6PGF3 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Med16Q6PGF3 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Med16Q6PGF3 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Med16Q6PGF3 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Med16Q6PGF3 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Med16Q6PGF3 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Med16Q6PGF3 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Med16Q6PGF3 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Med16Q6PGF3 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Med16Q6PGF3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Med16Q6PGF3 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Med16Q6PGF3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Med16Q6PGF3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Med16Q6PGF3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Med16Q6PGF3 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Med16Q6PGF3 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Med16Q6PGF3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Med16Q6PGF3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Med16Q6PGF3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Med16Q6PGF3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Med16Q6PGF3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Med16Q6PGF3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Med16Q6PGF3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Med16Q6PGF3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Med16Q6PGF3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Med16Q6PGF3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Med16Q6PGF3 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Med16Q6PGF3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Med16Q6PGF3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Med16Q6PGF3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Med16Q6PGF3 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Med16Q6PGF3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Med16Q6PGF3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Med16Q6PGF3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Med16Q6PGF3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Med16Q6PGF3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Med16Q6PGF3 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Med16Q6PGF3 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Med16Q6PGF3 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Med16Q6PGF3 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Med16Q6PGF3 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Med16Q6PGF3 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms