Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFF0

Scaf4, SR-related CTD-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf4Q6PFF0 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms