Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rad54bQ6PFE3 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rad54bQ6PFE3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rad54bQ6PFE3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rad54bQ6PFE3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad54bQ6PFE3 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad54bQ6PFE3 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad54bQ6PFE3 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad54bQ6PFE3 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad54bQ6PFE3 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad54bQ6PFE3 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad54bQ6PFE3 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad54bQ6PFE3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad54bQ6PFE3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad54bQ6PFE3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad54bQ6PFE3 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad54bQ6PFE3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad54bQ6PFE3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad54bQ6PFE3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad54bQ6PFE3 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad54bQ6PFE3 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad54bQ6PFE3 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad54bQ6PFE3 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad54bQ6PFE3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad54bQ6PFE3 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad54bQ6PFE3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad54bQ6PFE3 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad54bQ6PFE3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rad54bQ6PFE3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rad54bQ6PFE3 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rad54bQ6PFE3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rad54bQ6PFE3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms