Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDZ2

Taf1c, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1cQ6PDZ2 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms