Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms