Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDJ1

Cachd1, VWFA and cache domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cachd1Q6PDJ1 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cachd1Q6PDJ1 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cachd1Q6PDJ1 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cachd1Q6PDJ1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cachd1Q6PDJ1 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cachd1Q6PDJ1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cachd1Q6PDJ1 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cachd1Q6PDJ1 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cachd1Q6PDJ1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cachd1Q6PDJ1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cachd1Q6PDJ1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cachd1Q6PDJ1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cachd1Q6PDJ1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cachd1Q6PDJ1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cachd1Q6PDJ1 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cachd1Q6PDJ1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cachd1Q6PDJ1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cachd1Q6PDJ1 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cachd1Q6PDJ1 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cachd1Q6PDJ1 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cachd1Q6PDJ1 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cachd1Q6PDJ1 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cachd1Q6PDJ1 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cachd1Q6PDJ1 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cachd1Q6PDJ1 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cachd1Q6PDJ1 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cachd1Q6PDJ1 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cachd1Q6PDJ1 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cachd1Q6PDJ1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cachd1Q6PDJ1 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cachd1Q6PDJ1 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cachd1Q6PDJ1 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cachd1Q6PDJ1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cachd1Q6PDJ1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cachd1Q6PDJ1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cachd1Q6PDJ1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cachd1Q6PDJ1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cachd1Q6PDJ1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cachd1Q6PDJ1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cachd1Q6PDJ1 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cachd1Q6PDJ1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cachd1Q6PDJ1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cachd1Q6PDJ1 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cachd1Q6PDJ1 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cachd1Q6PDJ1 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cachd1Q6PDJ1 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cachd1Q6PDJ1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cachd1Q6PDJ1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cachd1Q6PDJ1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cachd1Q6PDJ1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cachd1Q6PDJ1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cachd1Q6PDJ1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cachd1Q6PDJ1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cachd1Q6PDJ1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cachd1Q6PDJ1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cachd1Q6PDJ1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cachd1Q6PDJ1 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cachd1Q6PDJ1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cachd1Q6PDJ1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cachd1Q6PDJ1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cachd1Q6PDJ1 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cachd1Q6PDJ1 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cachd1Q6PDJ1 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Cachd1Q6PDJ1 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Cachd1Q6PDJ1 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cachd1Q6PDJ1 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cachd1Q6PDJ1 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cachd1Q6PDJ1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cachd1Q6PDJ1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cachd1Q6PDJ1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cachd1Q6PDJ1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cachd1Q6PDJ1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cachd1Q6PDJ1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cachd1Q6PDJ1 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cachd1Q6PDJ1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cachd1Q6PDJ1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cachd1Q6PDJ1 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cachd1Q6PDJ1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cachd1Q6PDJ1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cachd1Q6PDJ1 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cachd1Q6PDJ1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cachd1Q6PDJ1 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cachd1Q6PDJ1 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cachd1Q6PDJ1 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cachd1Q6PDJ1 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cachd1Q6PDJ1 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cachd1Q6PDJ1 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cachd1Q6PDJ1 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cachd1Q6PDJ1 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cachd1Q6PDJ1 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cachd1Q6PDJ1 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cachd1Q6PDJ1 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cachd1Q6PDJ1 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cachd1Q6PDJ1 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cachd1Q6PDJ1 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cachd1Q6PDJ1 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cachd1Q6PDJ1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cachd1Q6PDJ1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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