Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD19

UPF0668 protein C10orf76 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6PD19 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q6PD19 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q6PD19 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Q6PD19 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q6PD19 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q6PD19 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q6PD19 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q6PD19 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q6PD19 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q6PD19 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q6PD19 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q6PD19 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q6PD19 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q6PD19 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q6PD19 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q6PD19 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q6PD19 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q6PD19 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q6PD19 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q6PD19 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q6PD19 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q6PD19 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q6PD19 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q6PD19 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q6PD19 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q6PD19 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q6PD19 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q6PD19 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q6PD19 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q6PD19 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q6PD19 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q6PD19 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q6PD19 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q6PD19 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q6PD19 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q6PD19 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q6PD19 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q6PD19 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q6PD19 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q6PD19 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q6PD19 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q6PD19 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q6PD19 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q6PD19 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Q6PD19 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q6PD19 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q6PD19 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q6PD19 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q6PD19 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q6PD19 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q6PD19 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q6PD19 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q6PD19 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q6PD19 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q6PD19 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q6PD19 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q6PD19 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q6PD19 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q6PD19 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q6PD19 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q6PD19 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q6PD19 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q6PD19 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q6PD19 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q6PD19 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q6PD19 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q6PD19 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q6PD19 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q6PD19 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q6PD19 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q6PD19 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q6PD19 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q6PD19 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q6PD19 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q6PD19 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q6PD19 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q6PD19 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q6PD19 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q6PD19 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q6PD19 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Q6PD19 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q6PD19 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q6PD19 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q6PD19 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q6PD19 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q6PD19 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q6PD19 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q6PD19 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q6PD19 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q6PD19 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q6PD19 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q6PD19 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q6PD19 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Q6PD19 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q6PD19 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q6PD19 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q6PD19 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q6PD19 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q6PD19 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q6PD19 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms