Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8W9

Hmgb4, High mobility group protein B4, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgb4Q6P8W9 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmgb4Q6P8W9 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmgb4Q6P8W9 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmgb4Q6P8W9 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmgb4Q6P8W9 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmgb4Q6P8W9 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmgb4Q6P8W9 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmgb4Q6P8W9 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmgb4Q6P8W9 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmgb4Q6P8W9 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmgb4Q6P8W9 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmgb4Q6P8W9 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmgb4Q6P8W9 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmgb4Q6P8W9 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmgb4Q6P8W9 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmgb4Q6P8W9 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmgb4Q6P8W9 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmgb4Q6P8W9 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmgb4Q6P8W9 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmgb4Q6P8W9 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmgb4Q6P8W9 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmgb4Q6P8W9 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmgb4Q6P8W9 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmgb4Q6P8W9 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmgb4Q6P8W9 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmgb4Q6P8W9 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmgb4Q6P8W9 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmgb4Q6P8W9 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmgb4Q6P8W9 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmgb4Q6P8W9 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmgb4Q6P8W9 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmgb4Q6P8W9 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmgb4Q6P8W9 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmgb4Q6P8W9 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmgb4Q6P8W9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmgb4Q6P8W9 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmgb4Q6P8W9 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmgb4Q6P8W9 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmgb4Q6P8W9 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmgb4Q6P8W9 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmgb4Q6P8W9 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmgb4Q6P8W9 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmgb4Q6P8W9 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmgb4Q6P8W9 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmgb4Q6P8W9 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmgb4Q6P8W9 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmgb4Q6P8W9 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmgb4Q6P8W9 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmgb4Q6P8W9 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmgb4Q6P8W9 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmgb4Q6P8W9 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmgb4Q6P8W9 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmgb4Q6P8W9 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmgb4Q6P8W9 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmgb4Q6P8W9 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmgb4Q6P8W9 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmgb4Q6P8W9 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmgb4Q6P8W9 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmgb4Q6P8W9 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmgb4Q6P8W9 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmgb4Q6P8W9 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmgb4Q6P8W9 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmgb4Q6P8W9 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmgb4Q6P8W9 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmgb4Q6P8W9 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmgb4Q6P8W9 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmgb4Q6P8W9 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmgb4Q6P8W9 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmgb4Q6P8W9 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmgb4Q6P8W9 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmgb4Q6P8W9 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmgb4Q6P8W9 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmgb4Q6P8W9 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmgb4Q6P8W9 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmgb4Q6P8W9 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmgb4Q6P8W9 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmgb4Q6P8W9 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmgb4Q6P8W9 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmgb4Q6P8W9 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmgb4Q6P8W9 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmgb4Q6P8W9 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmgb4Q6P8W9 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmgb4Q6P8W9 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmgb4Q6P8W9 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmgb4Q6P8W9 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmgb4Q6P8W9 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmgb4Q6P8W9 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmgb4Q6P8W9 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmgb4Q6P8W9 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmgb4Q6P8W9 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmgb4Q6P8W9 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmgb4Q6P8W9 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmgb4Q6P8W9 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmgb4Q6P8W9 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmgb4Q6P8W9 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmgb4Q6P8W9 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmgb4Q6P8W9 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmgb4Q6P8W9 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmgb4Q6P8W9 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmgb4Q6P8W9 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms