Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5E6

Gga2, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA2, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga2Q6P5E6 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gga2Q6P5E6 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gga2Q6P5E6 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gga2Q6P5E6 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gga2Q6P5E6 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gga2Q6P5E6 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gga2Q6P5E6 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gga2Q6P5E6 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gga2Q6P5E6 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gga2Q6P5E6 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gga2Q6P5E6 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gga2Q6P5E6 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gga2Q6P5E6 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gga2Q6P5E6 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gga2Q6P5E6 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gga2Q6P5E6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gga2Q6P5E6 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gga2Q6P5E6 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gga2Q6P5E6 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms