Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smchd1Q6P5D8 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Smchd1Q6P5D8 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smchd1Q6P5D8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smchd1Q6P5D8 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smchd1Q6P5D8 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smchd1Q6P5D8 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Smchd1Q6P5D8 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Smchd1Q6P5D8 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smchd1Q6P5D8 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smchd1Q6P5D8 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smchd1Q6P5D8 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smchd1Q6P5D8 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smchd1Q6P5D8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smchd1Q6P5D8 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smchd1Q6P5D8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smchd1Q6P5D8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smchd1Q6P5D8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smchd1Q6P5D8 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smchd1Q6P5D8 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smchd1Q6P5D8 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smchd1Q6P5D8 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smchd1Q6P5D8 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smchd1Q6P5D8 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smchd1Q6P5D8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smchd1Q6P5D8 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smchd1Q6P5D8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smchd1Q6P5D8 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smchd1Q6P5D8 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smchd1Q6P5D8 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smchd1Q6P5D8 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smchd1Q6P5D8 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smchd1Q6P5D8 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smchd1Q6P5D8 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Smchd1Q6P5D8 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smchd1Q6P5D8 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smchd1Q6P5D8 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smchd1Q6P5D8 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Smchd1Q6P5D8 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smchd1Q6P5D8 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Smchd1Q6P5D8 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Smchd1Q6P5D8 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smchd1Q6P5D8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smchd1Q6P5D8 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Smchd1Q6P5D8 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Smchd1Q6P5D8 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smchd1Q6P5D8 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smchd1Q6P5D8 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smchd1Q6P5D8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smchd1Q6P5D8 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smchd1Q6P5D8 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smchd1Q6P5D8 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Smchd1Q6P5D8 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Smchd1Q6P5D8 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Smchd1Q6P5D8 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smchd1Q6P5D8 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Smchd1Q6P5D8 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smchd1Q6P5D8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smchd1Q6P5D8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smchd1Q6P5D8 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smchd1Q6P5D8 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smchd1Q6P5D8 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smchd1Q6P5D8 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smchd1Q6P5D8 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Smchd1Q6P5D8 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smchd1Q6P5D8 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smchd1Q6P5D8 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smchd1Q6P5D8 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smchd1Q6P5D8 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smchd1Q6P5D8 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smchd1Q6P5D8 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smchd1Q6P5D8 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smchd1Q6P5D8 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smchd1Q6P5D8 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smchd1Q6P5D8 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smchd1Q6P5D8 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smchd1Q6P5D8 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smchd1Q6P5D8 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smchd1Q6P5D8 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smchd1Q6P5D8 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smchd1Q6P5D8 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smchd1Q6P5D8 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smchd1Q6P5D8 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smchd1Q6P5D8 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smchd1Q6P5D8 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smchd1Q6P5D8 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smchd1Q6P5D8 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smchd1Q6P5D8 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smchd1Q6P5D8 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smchd1Q6P5D8 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smchd1Q6P5D8 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smchd1Q6P5D8 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Smchd1Q6P5D8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smchd1Q6P5D8 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smchd1Q6P5D8 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Smchd1Q6P5D8 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Smchd1Q6P5D8 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smchd1Q6P5D8 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smchd1Q6P5D8 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smchd1Q6P5D8 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms