Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rprd2Q6NXI6 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms