Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFZ6

Krt77, Keratin, type II cytoskeletal 1b, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt77Q6IFZ6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
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Krt77Q6IFZ6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Krt77Q6IFZ6 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
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Krt77Q6IFZ6 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Krt77Q6IFZ6 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Krt77Q6IFZ6 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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